Kansallinen metsästyslainsäädäntö on linjassa lintudirektiivin kanssa. Merkittävimpänä ongelmana ovat itsehallintoalueet, joiden lainsäädäntö on lintudirektiivin vastainen. Erillisten itsehallintoalueiden lainsäädäntö on ristiriidassa lintudirektiivin kanssa seuraavissa tapauksissa:

• Sepelkyyhkyjen kevätmetsästyksen salliminen helmikuusta maaliskuulle Navarrassa ja Baskimaassa.
• Andalusiassa, Extremadurassa ja Kantabriassa saa helmikuussa ampua rastaita, kyyhkyjä ja lehtokurppia.
• Useilla alueilla saa metsästää myös pesimäkauden aikana sepelkyyhkyjä, turturikyyhkyjä ja viiriäisiä.
• Muutamilla alueilla saa metsästää lajeja, joita lintudirektiivin mukaan ei saisi laillisesti metsästää. Muun muassa mustakottarainen kuuluu tietyillä alueilla riistalajeihin.
• Erityisesti Andalusiassa, Kataloniassa, Valenciassa ja Murciassa pyydystetään pieniä määriä peippoja verkoilla ja liimalla enimmäkseen häkkilinnuiksi.
• Mallorcan saarella pyydystetään lokakuusta marraskuuhun verkoilla satojatuhansia rastaita.

Kansallinen lainsäädäntö saatiin linjaan lintudirektiivin kanssa vasta, kun Espanjan BirdLife (SEO, Sociedad Espanola Ornitologia) teki valituksen Euroopan komissiolle Espanjan suojelulainsäädännön puutteista. Komissio aloitti toimenpiteet.

Komission toimenpiteiden johdosta kansallinen laki on noudattanut vuodesta 1997 saakka lintudirektiivin säännöksiä, mutta valitettavasti itsehallintoalueet suhtautuvat edelleen vastahakoisesti oman paikallisen lainsäädäntönsä muuttamiseen.

Euroopan yhteisöjen tuomioistuin tuomitsi kesällä 2005 Espanjassa paikallistasolla tapahtuvan sepelkyyhkyn kevätmetsästyksen lintudirektiivin vastaiseksi. Myös muita oikeusprosesseja on meneillään SEO:n tuella.

SEO tutkii kansallisen lainsäädännön uusia julkaistuja säännöksiä aina ennen metsästyskauden alkua löytääkseen laista ne kohdat, jotka eivät ole linjassa lintudirektiivin kanssa. Oikeustoimenpiteet lainsäätäjiä vastaan aloitetaan aina tilanteen niin vaatiessa.

SEO toimii aktiivisesti kampanjoiden ja valistaen varsinkin nuorison keskuudessa. Yhdistys on suunnitellut ympäristönsuojeluun liittyvää materiaalia, jota käytetään kansallisten luontokeskusten koulutusohjelmissa. Järjestö on onnistunut kampanjoimaan median avulla lainsäädännön muutosten puolesta. Tämä on ollut erittäin tärkeää suojelijoille, joilla on vastassaan suurta poliittista vaikutusvaltaa nauttivat laitonta metsästystä tukevat metsästyspiirit.

SEO on ollut toteuttamassa uhanalaisten lintulajien suojelemiseksi laadittua toimintasuunnitelmaa ja vastustanut kansallisella kampanjoinnilla, yhdessä muiden luonnonsuojelujärjestöjen kanssa, petolintujen ja muiden petoeläinten laitonta myrkyttämistä. Kampanjan tuloksena kolme henkilöä tuomittiin kahdeksi vuodeksi vankeuteen ja maksamaan suuret sakot vuorikotkien laittomasta myrkyttämisestä.